دبیر شورای عالی امنیت ملی در پیامی، درگذشت آیت‌الله شبیری زنجانی را تسلیت گفت. او با ابراز تأسف از این واقعه، به خدمات و نقش مهم این عالم بزرگ در جامعه اشاره کرد و یادآور شد که فقدان ایشان ضایعه‌ای بزرگ برای کشور است.